14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2427 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  100 
 
 		 427 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2321  putative O-antigen transporter  56 
 
 		 426 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0603153  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2314  putative O-antigen transporter  56 
 
 		 426 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0335708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2213  putative O-antigen transporter  55.53 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3186  LPS side chain defect: putative O-antigen transferase  39.34 
 
 		 435 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.15241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3785  polysaccharide biosynthesis protein  35.9 
 
 		 442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  20.27 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  23.05 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>