20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3785 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3785  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 442 aa  876    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3186  LPS side chain defect: putative O-antigen transferase  35.63 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.15241  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  35.9 
 
 		 427 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2213  putative O-antigen transporter  34.21 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163882  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2314  putative O-antigen transporter  33.97 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0335708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2321  putative O-antigen transporter  33.97 
 
 		 426 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0603153  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 		 468 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2971  O antigen flippase  23.33 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.436606  hitchhiker  0.000000132287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 442 aa  54.3  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4935  polysaccharide biosynthesis protein  19.14 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  24.15 
 
 		 485 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.89 
 
 		 504 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>