18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2971 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2971  O antigen flippase  100 
 
 		 461 aa  915    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.436606  hitchhiker  0.000000132287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  34.8 
 
 		 418 aa  273  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 457 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0724  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4935  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3785  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2321  putative O-antigen transporter  22.81 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0603153  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  32.21 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2314  putative O-antigen transporter  22.55 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0335708 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3499  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2213  putative O-antigen transporter  22.55 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4456  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 458 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>