14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0724 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0724  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 448 aa  880    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  32.27 
 
 		 457 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3499  polysaccharide biosynthesis protein  28.62 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2971  O antigen flippase  25.14 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.436606  hitchhiker  0.000000132287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4935  polysaccharide biosynthesis protein  20.28 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  20.64 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 494 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>