34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001771 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  100 
 
 		 435 aa  864    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  37.56 
 
 		 436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  34.14 
 
 		 436 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  31.84 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  29.02 
 
 		 507 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  28.41 
 
 		 492 aa  146  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  30.25 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  26.32 
 
 		 496 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 538 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 466 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 495 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 439 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 463 aa  99.8  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.14 
 
 		 445 aa  99.8  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 413 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  23.28 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  18.73 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  23.03 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  19.6 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  21.79 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  23.4 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  20.69 
 
 		 494 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  23.18 
 
 		 475 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  34.55 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>