34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21000 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  100 
 
 		 445 aa  880    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  31.71 
 
 		 492 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  30.3 
 
 		 405 aa  150  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  28.51 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  30.53 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 421 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  32.02 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  29.64 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  29.5 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 		 476 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  32.11 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  28.61 
 
 		 466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  23.18 
 
 		 507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  24.87 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  24.67 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  22.99 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  24.79 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3401  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 392 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0712033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6176  hypothetical protein  28.87 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.59 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3273  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>