35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1420 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  100 
 
 		 405 aa  793    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  38.24 
 
 		 421 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  34.53 
 
 		 496 aa  235  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  34.25 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  33.25 
 
 		 495 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  34.42 
 
 		 538 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  33.08 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  35 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  35.37 
 
 		 427 aa  192  9e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  33.33 
 
 		 507 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  30.88 
 
 		 466 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  30.46 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  33.24 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  31.6 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  30.05 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 		 436 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.59 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  30.84 
 
 		 431 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  27.68 
 
 		 436 aa  136  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  22.02 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 427 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.05 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 494 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  19.33 
 
 		 483 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  30.33 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 475 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  21.79 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  19.76 
 
 		 498 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  21.29 
 
 		 493 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  19.91 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>