30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4426 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 427 aa  852    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 449 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 495 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  27.1 
 
 		 496 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  28.85 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 		 492 aa  99.8  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  23.68 
 
 		 507 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 439 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  25.93 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  22.51 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 538 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.67 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  23.1 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  21.94 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  24.16 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 426 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 476 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  27.01 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 486 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>