36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1563 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 436 aa  854    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  48.14 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  34.14 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  30.21 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  33.25 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  29.61 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  28.5 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  31.35 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  33.05 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  27.9 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  29.06 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  30.79 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  31.76 
 
 		 476 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  31.38 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  28.45 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  29.08 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  28.26 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  33.94 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  32.84 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  28.47 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  25.86 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  25.54 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  21.86 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  23 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.08 
 
 		 488 aa  47.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  22.53 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  20.5 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 494 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23.97 
 
 		 483 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 476 aa  43.1  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>