45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2622 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 431 aa  845    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  30.21 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  31.44 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  31.18 
 
 		 435 aa  209  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  31.31 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  30.81 
 
 		 405 aa  146  9e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  27.34 
 
 		 496 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  28.14 
 
 		 507 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  28.05 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 431 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 538 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  26.67 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 459 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  21.53 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23.14 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  21.21 
 
 		 435 aa  57  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  22.04 
 
 		 492 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  18.73 
 
 		 500 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 487 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  20.21 
 
 		 500 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  22.22 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  21.46 
 
 		 506 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3401  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0712033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.14 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  19.71 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  20.21 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  20.77 
 
 		 501 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 501 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 490 aa  43.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>