32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3022 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 466 aa  926    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  47.42 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  36.6 
 
 		 492 aa  228  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  33.16 
 
 		 495 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  30.56 
 
 		 496 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  32.27 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  31.93 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  30.54 
 
 		 427 aa  169  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  27.85 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 538 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  30.42 
 
 		 449 aa  147  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.23 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  29.64 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  28.85 
 
 		 445 aa  126  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  23.62 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 431 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 419 aa  97.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  23.3 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  21.73 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  22.16 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  21.9 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  21.28 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  23.68 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  21.7 
 
 		 493 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3401  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0712033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>