12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0588 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  87.75 
 
 		 403 aa  683    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  100 
 
 		 403 aa  813    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  72.7 
 
 		 403 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  63.2 
 
 		 401 aa  521  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  18.75 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 426 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5908  polysaccharide biosynthesis protein  30.6 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6176  hypothetical protein  30.6 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>