51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4759 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 431 aa  860    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 492 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  30.67 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  30.99 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  29.95 
 
 		 495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 		 427 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  29.25 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 413 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  24.35 
 
 		 435 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 466 aa  123  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  28.57 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  23.22 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 426 aa  97.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  29.66 
 
 		 459 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  25.46 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  25.36 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  24.38 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5908  polysaccharide biosynthesis protein  30.46 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6176  hypothetical protein  29.89 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  24.32 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  21.83 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  20.63 
 
 		 507 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.04 
 
 		 479 aa  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 475 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 503 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  20.26 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  20.26 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  19.68 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  20.26 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  20.26 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  20.26 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  24.29 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  19.2 
 
 		 505 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3273  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 418 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  25.15 
 
 		 474 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  25.15 
 
 		 475 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  19.84 
 
 		 483 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1355  hypothetical protein  21.6 
 
 		 424 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>