18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6176 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5908  polysaccharide biosynthesis protein  98.05 
 
 		 410 aa  782    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314086 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  86.59 
 
 		 410 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6176  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1355  hypothetical protein  65.78 
 
 		 424 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3270  putative O-antigen translocase  64.25 
 
 		 414 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3257  hypothetical protein  64.32 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3218  hypothetical protein  64.08 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3273  polysaccharide biosynthesis protein  54.75 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.18 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  20.79 
 
 		 507 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 467 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  21.68 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  29.1 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  30.6 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  27.78 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>