16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3176 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  100 
 
 		 403 aa  810    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  72.7 
 
 		 403 aa  589  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  74.37 
 
 		 403 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  62.16 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  19.55 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  21 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  19.6 
 
 		 421 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  20.29 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6176  hypothetical protein  27.78 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5908  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>