55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1503 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 421 aa  848    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  40 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  33.08 
 
 		 492 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  30.14 
 
 		 419 aa  183  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 538 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  31.52 
 
 		 495 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  31.65 
 
 		 496 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  28.8 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 466 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 427 aa  159  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  28.83 
 
 		 445 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  28.61 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  29.68 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  26.17 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  24.04 
 
 		 436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 426 aa  96.3  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  19.89 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23.25 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  22.93 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  22.25 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.33 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2587  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 508 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 533 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  20.23 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  19.7 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  21.39 
 
 		 501 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 475 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  19.37 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  20.89 
 
 		 505 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  20.57 
 
 		 486 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  21.11 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  20.58 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  20.05 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 479 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  20.24 
 
 		 530 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>