38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1868 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  100 
 
 		 436 aa  848    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  48.14 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  36.82 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  31.41 
 
 		 431 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  32.45 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  28.47 
 
 		 507 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  28.22 
 
 		 496 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  29.98 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  28.23 
 
 		 466 aa  133  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  27.68 
 
 		 405 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 449 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  29.78 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  29.26 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  31.69 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  28.52 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.22 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  29.25 
 
 		 497 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 494 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  22.92 
 
 		 401 aa  46.6  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  21.54 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  20.74 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.52 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 508 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>