30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0388 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 463 aa  926    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  44.93 
 
 		 449 aa  325  7e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  33.5 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  34.72 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  32.94 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  30.03 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  30.35 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  31.4 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  31.77 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 		 431 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  29.2 
 
 		 507 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  30.67 
 
 		 538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 476 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  25.75 
 
 		 436 aa  126  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 421 aa  120  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  23.92 
 
 		 435 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 		 431 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  23.63 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 426 aa  89.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  27.3 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23.65 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 497 aa  46.6  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  22.43 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  22.43 
 
 		 506 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1426  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 455 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>