30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2377 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 492 aa  967    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  50.31 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  52.4 
 
 		 495 aa  480  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  34.7 
 
 		 538 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  32.85 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  34.25 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  34.96 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  36.04 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  31.41 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  32.45 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  33.25 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  32.56 
 
 		 421 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  36.16 
 
 		 413 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  33.8 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  32.61 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  30.24 
 
 		 431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 		 476 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  31.71 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  28.12 
 
 		 435 aa  143  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  36.73 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 		 431 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  31.01 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  23.48 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  21.29 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3401  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 392 aa  53.9  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0712033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  21 
 
 		 403 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  22.16 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 507 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>