46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0587 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 495 aa  984    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  49.49 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  52.07 
 
 		 492 aa  497  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  34.43 
 
 		 507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  32.39 
 
 		 538 aa  269  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  33.42 
 
 		 405 aa  219  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  33.07 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  32.4 
 
 		 439 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  33.24 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  30.35 
 
 		 431 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  29.98 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  31.83 
 
 		 436 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  32.56 
 
 		 449 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  35.91 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  32.29 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  30.35 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.64 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 431 aa  124  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  25.67 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 427 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  25.14 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  24.26 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 507 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  24.88 
 
 		 492 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  24.61 
 
 		 492 aa  47.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 471 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  24.08 
 
 		 492 aa  47  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.28 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.61 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  24.61 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  24.61 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.61 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  24.61 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  24.08 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  24.61 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  24.61 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.56 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.56 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>