16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7397 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6176  hypothetical protein  86.59 
 
 
410 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5908  polysaccharide biosynthesis protein  85.61 
 
 
410 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314086 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3270  putative O-antigen translocase  64.98 
 
 
414 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1355  hypothetical protein  65.95 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3257  hypothetical protein  64.73 
 
 
424 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3218  hypothetical protein  64.49 
 
 
414 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3273  polysaccharide biosynthesis protein  53.41 
 
 
418 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.44 
 
 
445 aa  59.7  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 
495 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  21.08 
 
 
507 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 
486 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>