39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0202 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 427 aa  833    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  36.32 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  32.67 
 
 		 463 aa  206  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  31.27 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  33.42 
 
 		 507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  34.64 
 
 		 405 aa  201  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  29.8 
 
 		 496 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  29.88 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  29.1 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 538 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 495 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 476 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  29.9 
 
 		 466 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  30.88 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  25.46 
 
 		 435 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.55 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  24.66 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  21.9 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  21.39 
 
 		 403 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  22.14 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  21.49 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  19.79 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3401  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 392 aa  50.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0712033  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6176  hypothetical protein  24.18 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5908  polysaccharide biosynthesis protein  21.95 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314086 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  19.24 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  19.08 
 
 		 492 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  23.27 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>