13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3556 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  100 
 
 		 403 aa  808    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  87.75 
 
 		 403 aa  706    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  74.37 
 
 		 403 aa  594  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  63.38 
 
 		 401 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  20.59 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5908  polysaccharide biosynthesis protein  29.1 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6176  hypothetical protein  29.1 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 492 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>