12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0454 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  100 
 
 		 401 aa  800    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  63.2 
 
 		 403 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  62.16 
 
 		 403 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  63.38 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  23.28 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  22.92 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  22.14 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>