32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1112 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  100 
 
 		 507 aa  999    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  59.88 
 
 		 538 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  34.5 
 
 		 495 aa  273  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  33.4 
 
 		 496 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  32.85 
 
 		 492 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  33.15 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  33.33 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.47 
 
 		 436 aa  169  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  31.2 
 
 		 431 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 436 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 421 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  28.09 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  28.44 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  29.95 
 
 		 459 aa  123  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  27.55 
 
 		 476 aa  121  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  23.46 
 
 		 445 aa  117  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  22.7 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 497 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  23.32 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  22.14 
 
 		 401 aa  45.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 487 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 483 aa  43.9  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>