26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1881 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 459 aa  837    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  33.85 
 
 		 492 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 		 495 aa  208  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  30.08 
 
 		 507 aa  206  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 		 538 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  32.9 
 
 		 496 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  34.17 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  30.85 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  36.08 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  28.21 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  31.96 
 
 		 436 aa  143  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  26.43 
 
 		 435 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  32.29 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  29 
 
 		 431 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  35.52 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 		 439 aa  116  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  26.97 
 
 		 449 aa  96.3  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  25.75 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  31.46 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>