25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3125 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 419 aa  836    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  30.14 
 
 		 421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  25.52 
 
 		 507 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  27.95 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  28.07 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  27.42 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 538 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 495 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  25.77 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  28.47 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 431 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  20.75 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  21.95 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  22.59 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  24.79 
 
 		 492 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>