58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0363 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 476 aa  909    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 427 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  31.85 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  31.62 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  31.51 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  32.45 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  28.37 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.85 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  27.04 
 
 		 507 aa  136  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  26.68 
 
 		 538 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  26.92 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  28.5 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 431 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  38.61 
 
 		 459 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 		 421 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  32.34 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  27.82 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  28.57 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  23.64 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3401  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0712033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  26.54 
 
 		 492 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  26.54 
 
 		 492 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  28.12 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  28.12 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  28.12 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  28.12 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  28.12 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  28.12 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  26.82 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  27.5 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  27.5 
 
 		 492 aa  52  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  27.5 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  24.57 
 
 		 508 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  27.5 
 
 		 492 aa  50.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  24.23 
 
 		 483 aa  50.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  27.07 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 497 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7397  hypothetical protein  30.3 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  29.9 
 
 		 484 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 		 442 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  29.17 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 480 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 		 484 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  20.36 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  25.87 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5908  polysaccharide biosynthesis protein  30.71 
 
 		 410 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6176  hypothetical protein  30.71 
 
 		 410 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 493 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>