25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1137 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1137  porS protein  100 
 
 
435 aa  869    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  23.97 
 
 
507 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  21.92 
 
 
405 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 
495 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
431 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  25.88 
 
 
496 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
492 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.52 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 
538 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 
439 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 
449 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  23.28 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
476 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  20.94 
 
 
435 aa  57.4  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.93 
 
 
488 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>