34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0698 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 449 aa  895    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  44.93 
 
 		 463 aa  345  7e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  36.32 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  33.8 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  30.69 
 
 		 496 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  31.6 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  32.46 
 
 		 495 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  30.52 
 
 		 439 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  30.08 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  29.47 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  29.68 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  26.92 
 
 		 507 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  29.38 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  29.97 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  29.68 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  28.45 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  25 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  28.76 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 459 aa  93.6  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  26.44 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23.2 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.67 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1426  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 508 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 484 aa  43.5  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1380  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0611611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  24.83 
 
 		 508 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>