54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2973 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 538 aa  1067    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  59.88 
 
 		 507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  32.39 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  32.66 
 
 		 496 aa  264  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  34.7 
 
 		 492 aa  262  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  34.42 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 439 aa  143  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  22.65 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  30.67 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  25.31 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  21.12 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 427 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 476 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 475 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1161  hypothetical protein  41.51 
 
 		 201 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1160  hypothetical protein  40.82 
 
 		 199 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1158  hypothetical protein  38.6 
 
 		 202 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  24.39 
 
 		 510 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.39 
 
 		 510 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.39 
 
 		 510 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  24.39 
 
 		 510 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  24.39 
 
 		 503 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  25.3 
 
 		 492 aa  47.4  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1155  hypothetical protein  44.44 
 
 		 239 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1156  hypothetical protein  41.67 
 
 		 205 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0631  virulence factor protein MviN  24.72 
 
 		 488 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0373858  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  24.39 
 
 		 492 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.78 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.78 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1163  hypothetical protein  43.18 
 
 		 199 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 		 499 aa  44.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.78 
 
 		 492 aa  44.3  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.78 
 
 		 492 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.78 
 
 		 492 aa  44.3  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.78 
 
 		 492 aa  43.9  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 509 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>