144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3104 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
502 aa  952    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  35.38 
 
 
515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  30.03 
 
 
487 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  30.63 
 
 
486 aa  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  32.64 
 
 
503 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  29.1 
 
 
489 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  31.12 
 
 
501 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  26.73 
 
 
505 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  30 
 
 
493 aa  143  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  30.59 
 
 
494 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  29.53 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  29.93 
 
 
483 aa  130  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 
487 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
479 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 
490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  29.53 
 
 
501 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 
498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 
509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  24.85 
 
 
483 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  28.73 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
477 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 
504 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  27.25 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  29.88 
 
 
508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  24.58 
 
 
492 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 
510 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
492 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 
484 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  24.55 
 
 
492 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  25.52 
 
 
510 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  24.34 
 
 
492 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  24.11 
 
 
492 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  24.11 
 
 
492 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  24.11 
 
 
492 aa  106  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  29.32 
 
 
488 aa  106  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 
507 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  27.23 
 
 
504 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  24.47 
 
 
492 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  24.11 
 
 
492 aa  105  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 
490 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
476 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  30.59 
 
 
575 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  31.71 
 
 
497 aa  100  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.3 
 
 
475 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 
498 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 
508 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  21.3 
 
 
474 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  29.75 
 
 
472 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 
493 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 
514 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  26.89 
 
 
497 aa  97.4  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  32.03 
 
 
502 aa  97.1  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  29.45 
 
 
504 aa  96.3  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  24.47 
 
 
503 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.47 
 
 
510 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  24.47 
 
 
510 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.47 
 
 
510 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  24.47 
 
 
510 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  30.15 
 
 
502 aa  94.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  19.94 
 
 
479 aa  95.1  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
488 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 
502 aa  94  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  28.11 
 
 
503 aa  94  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 
514 aa  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 
482 aa  90.9  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 
421 aa  90.1  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2291  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 
488 aa  90.1  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  28.53 
 
 
512 aa  87.8  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 
483 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 
493 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 
509 aa  87  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 
507 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
499 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 
530 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
491 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 
480 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 
482 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.53 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
483 aa  84.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 
492 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 
483 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  22.08 
 
 
488 aa  83.2  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  28.05 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 
490 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
493 aa  78.2  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 
467 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 
471 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 
492 aa  76.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  27.67 
 
 
467 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
533 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 
504 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 
481 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>