87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3178 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3178  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 457 aa  829    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.480735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4028  polysaccharide biosynthesis protein  84.65 
 
 		 456 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 471 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 		 474 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 461 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  28.37 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  25.06 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 504 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  32.45 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  29.02 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  34.81 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  31.21 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  30.65 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  38.1 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.64 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  34.25 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  35.47 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  27.42 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  33.73 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  32.45 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  33.7 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.12 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  25.31 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  26.46 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.38 
 
 		 517 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 		 495 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  32.76 
 
 		 135 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0796  hypothetical membrane associated protein  22.82 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.610272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0449  polysaccharide biosynthesis protein  34.91 
 
 		 502 aa  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.757285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  25.42 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  30.05 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 		 488 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1513  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  23.04 
 
 		 489 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 505 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  19.66 
 
 		 476 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 		 430 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 483 aa  46.6  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 539 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  29.73 
 
 		 523 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  32.22 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  21.78 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  30.85 
 
 		 536 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  30.48 
 
 		 458 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  33.59 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  22.75 
 
 		 501 aa  43.5  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 451 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 449 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>