113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0382 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 467 aa  921    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  28.79 
 
 		 494 aa  94  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  24.82 
 
 		 483 aa  89.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  24.22 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  21.94 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  26.39 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 		 488 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.24 
 
 		 488 aa  67  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.92 
 
 		 508 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  24.92 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  23.56 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  24.14 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  24.14 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.01 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 509 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  23.17 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  23.02 
 
 		 501 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  22.29 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  24.52 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 484 aa  53.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  22.29 
 
 		 500 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 476 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.02 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.02 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.02 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  22.59 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.02 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.02 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 497 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.49 
 
 		 492 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.02 
 
 		 492 aa  51.2  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 481 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 497 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 458 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 		 483 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.56 
 
 		 503 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 490 aa  50.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.56 
 
 		 510 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  22.64 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  21.28 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 499 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.56 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.56 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.56 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  20.93 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.65 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 575 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 503 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 503 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  19.09 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>