23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2144 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2144  O-antigen and teichoic acid-like export protein  100 
 
 		 387 aa  764    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0837  polysaccharide biosynthesis protein  31.23 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 		 411 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0498  polysaccharide biosynthesis protein  31.54 
 
 		 449 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5393  polysaccharide biosynthesis protein  29.62 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.376644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3640  polysaccharide biosynthesis protein  32.53 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.866884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4418  polysaccharide biosynthesis protein  29.26 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18700  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.25 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4010  hypothetical protein  23.08 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  29.72 
 
 		 512 aa  57  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0221  polysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.16 
 
 		 495 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  32.28 
 
 		 504 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0804  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 		 476 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  27.22 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 483 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  24.57 
 
 		 486 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1352  Na+-driven multidrug efflux pump  23.81 
 
 		 303 aa  43.1  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>