77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00691 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00691  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  897    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  26.78 
 
 		 475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  26.78 
 
 		 474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 487 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 479 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  19.81 
 
 		 503 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 		 515 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  20.38 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  22.98 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  19.18 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.04 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  20.22 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  18.73 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  23.37 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.77 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  19.69 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  19.49 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  19.49 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  19.49 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  19.49 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  19.49 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  22.93 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  21.89 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  18.85 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  18.85 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  18.85 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  19.17 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  18.85 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 530 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 499 aa  54.3  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  18.53 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  18.53 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  18.53 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  19.11 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  20.59 
 
 		 504 aa  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  19.06 
 
 		 510 aa  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  18.59 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  19.06 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 499 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 503 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  21.48 
 
 		 492 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 509 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  32.38 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  21.76 
 
 		 505 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 494 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  19.54 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  20.29 
 
 		 502 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 514 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 488 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  30.99 
 
 		 500 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  20.86 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  18.62 
 
 		 501 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  17.96 
 
 		 502 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 490 aa  43.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>