132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1313 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1313  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
553 aa  1103    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.221909  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  83.36 
 
 
553 aa  944    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  83.36 
 
 
553 aa  944    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  38.59 
 
 
550 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  39.06 
 
 
550 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  39.06 
 
 
550 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  39.24 
 
 
550 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  38 
 
 
542 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  38.88 
 
 
550 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  38.88 
 
 
550 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  38.88 
 
 
550 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  38.88 
 
 
550 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  38.88 
 
 
550 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  38.88 
 
 
550 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  37.68 
 
 
550 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  38.34 
 
 
541 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  36.91 
 
 
544 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  36.64 
 
 
544 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  36.79 
 
 
544 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  36.79 
 
 
544 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  38.66 
 
 
459 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  36.91 
 
 
544 aa  323  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  35.51 
 
 
544 aa  323  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  35.69 
 
 
544 aa  322  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  36.05 
 
 
544 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  38.66 
 
 
459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  38.66 
 
 
459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  38.66 
 
 
459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  38.23 
 
 
459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  35.92 
 
 
544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  38.23 
 
 
459 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  38.23 
 
 
459 aa  320  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  38.23 
 
 
459 aa  320  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  37.8 
 
 
459 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  38.23 
 
 
459 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  38.01 
 
 
459 aa  318  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0460  polysaccharide transporter  31.32 
 
 
552 aa  267  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000146874  normal  0.345583 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1293  polysaccharide biosynthesis protein  30.87 
 
 
549 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.619814  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0846  polysaccharide transporter  28.49 
 
 
554 aa  210  6e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151438  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1390  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.16 
 
 
544 aa  200  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.106495  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0388  polysaccharide transporter  29.68 
 
 
543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.379787  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0636  polysaccharide transporter  27.69 
 
 
647 aa  193  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0117  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
564 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  25.9 
 
 
517 aa  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1986  hypothetical protein  23.53 
 
 
557 aa  150  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0493  polysaccharide transporter  26.65 
 
 
527 aa  148  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
539 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2607  virulence factor MVIN family protein  24.83 
 
 
544 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 
506 aa  144  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 
535 aa  143  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 
519 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  25.93 
 
 
506 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  26.35 
 
 
506 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  26.65 
 
 
506 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0009  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 
526 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 
506 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  26.65 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  26.75 
 
 
506 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  26.75 
 
 
506 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  27.13 
 
 
506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0905  polysaccharide transporter  26.39 
 
 
484 aa  130  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 
506 aa  127  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 
534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 
529 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0060  polysaccharide synthase family protein  26.62 
 
 
533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5256  polysaccharide synthase family protein  26.17 
 
 
533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0050  polysaccharide biosynthesis protein  26.68 
 
 
533 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  26.23 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131494  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  24.81 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0054  stage V sporulation protein B  26.23 
 
 
533 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0054  stage V sporulation protein B  26.23 
 
 
533 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1794  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
535 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000923307  normal  0.17508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  26.01 
 
 
533 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  24.91 
 
 
510 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0061  polysaccharide synthase family protein  25.76 
 
 
533 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0053  stage V sporulation protein B, putative  26.34 
 
 
533 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0064  polysaccharide synthase family protein  26.34 
 
 
533 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1413  stage V sporulation protein B  21.29 
 
 
538 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.208509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1223  stage V sporulation protein B  21.4 
 
 
538 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.30797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
517 aa  98.6  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  22.65 
 
 
512 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0142  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 
513 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  25.77 
 
 
520 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  19.75 
 
 
522 aa  84  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0529  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 
518 aa  83.6  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  22.36 
 
 
529 aa  83.2  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0052  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
526 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0050  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
516 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0526  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
508 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0539  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
508 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.41345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  22.62 
 
 
517 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2939  stage V sporulation protein B  23.21 
 
 
522 aa  77  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000274011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  23.16 
 
 
519 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  23.16 
 
 
519 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  22.89 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  22.89 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  22.89 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  22.89 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  22.89 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  20.48 
 
 
513 aa  73.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>