47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6289 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1231    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  36.72 
 
 
618 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  36.23 
 
 
618 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  36.32 
 
 
595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  36.32 
 
 
595 aa  323  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  36.41 
 
 
618 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  37.74 
 
 
608 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  34.72 
 
 
634 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  36.48 
 
 
707 aa  287  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  35.04 
 
 
658 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  35.04 
 
 
658 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  35.04 
 
 
658 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  34.88 
 
 
1533 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  30.64 
 
 
631 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  34.82 
 
 
662 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  35.04 
 
 
614 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  34.66 
 
 
636 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  32.51 
 
 
615 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  29.3 
 
 
1103 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 
1103 aa  194  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  34.05 
 
 
592 aa  187  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  28.95 
 
 
636 aa  178  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  24.78 
 
 
585 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  27.16 
 
 
592 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  27.38 
 
 
638 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  28 
 
 
638 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  37.1 
 
 
290 aa  87.8  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  35.48 
 
 
893 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  36.7 
 
 
272 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  22.54 
 
 
597 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  29 
 
 
588 aa  81.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  24.58 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  25.25 
 
 
596 aa  76.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.83 
 
 
292 aa  53.9  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1962  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.62 
 
 
281 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.21 
 
 
276 aa  50.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 
424 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3123  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.41 
 
 
256 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
341 aa  49.7  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  31.61 
 
 
295 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  36.05 
 
 
259 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
320 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  23.72 
 
 
261 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  30.53 
 
 
255 aa  44.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
374 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.42 
 
 
261 aa  43.9  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.29 
 
 
304 aa  43.9  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>