41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1962 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1962  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
281 aa  566  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  45.35 
 
 
597 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1571  glycosyl transferase family protein  42.5 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2522  hydrolase, exosortase system type 1 associated  45.52 
 
 
275 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.75 
 
 
276 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0274  esterase/lipase/thioesterase family protein  41.76 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.126807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0697  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.76 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3123  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.73 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  34.33 
 
 
290 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  35.07 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  43.7 
 
 
634 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  29.46 
 
 
638 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  31.07 
 
 
638 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  35.24 
 
 
893 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  28.16 
 
 
588 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.08 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  33.62 
 
 
605 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  37.74 
 
 
456 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  28.99 
 
 
474 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  38.81 
 
 
413 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.81 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  33.59 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  32.67 
 
 
592 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0385  hypothetical protein  46.03 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  30.83 
 
 
1103 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  26.89 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  35.29 
 
 
690 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  29.46 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  37.8 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  30.1 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  39.71 
 
 
631 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  33.75 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  33.61 
 
 
707 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  37.65 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 
1103 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  28.83 
 
 
677 aa  42.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  30.65 
 
 
618 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  30.1 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  27.61 
 
 
674 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
272 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>