26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3123 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3123  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 		 256 aa  494  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1962  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.51 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1571  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.08 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0274  esterase/lipase/thioesterase family protein  35 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.126807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  38.12 
 
 		 597 aa  98.6  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0697  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.33 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2522  hydrolase, exosortase system type 1 associated  36.41 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  36.32 
 
 		 638 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  38.06 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  33.52 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  36.61 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  40.8 
 
 		 634 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  35.71 
 
 		 893 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  38.41 
 
 		 605 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  34.05 
 
 		 592 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  32.8 
 
 		 597 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.5 
 
 		 631 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  34.33 
 
 		 588 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  28.19 
 
 		 636 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  26.4 
 
 		 585 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  27.95 
 
 		 596 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  28.85 
 
 		 1103 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  32.58 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  43.06 
 
 		 614 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  30.57 
 
 		 1103 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>