55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2523 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  100 
 
 
295 aa  587  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  56.69 
 
 
292 aa  329  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  56.84 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  58.25 
 
 
304 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  45.17 
 
 
285 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  46.46 
 
 
288 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  41.1 
 
 
304 aa  205  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
280 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2342  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.27 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  28.48 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0305  hypothetical protein  46.53 
 
 
131 aa  89  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1934  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
264 aa  89  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  35.34 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  35.97 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  22.94 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  27.11 
 
 
261 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  40 
 
 
451 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  34.72 
 
 
618 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  33.12 
 
 
638 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  33.76 
 
 
638 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  34.72 
 
 
618 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  26.35 
 
 
615 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  26.57 
 
 
597 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  32.85 
 
 
595 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  32.62 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  29.65 
 
 
614 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  22.56 
 
 
311 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  22.11 
 
 
585 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  26.2 
 
 
592 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  33.06 
 
 
595 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.74 
 
 
631 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  22.7 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
374 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3188  hypothetical protein  36.36 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  26.39 
 
 
636 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  29.38 
 
 
634 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  36.28 
 
 
592 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  24.56 
 
 
442 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  29.2 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0306  hypothetical protein  34.78 
 
 
82 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  31.25 
 
 
605 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  24.24 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  27.59 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  24.16 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  39.13 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  27.08 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
597 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  27.07 
 
 
222 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 
1103 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 
1103 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  29.84 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  32.12 
 
 
608 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>