145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0694 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
288 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  51.46 
 
 
285 aa  278  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  46.46 
 
 
295 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  46.29 
 
 
304 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  47.29 
 
 
318 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.79 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  42.76 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  39.43 
 
 
280 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2342  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.21 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1934  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0305  hypothetical protein  43.7 
 
 
131 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  33.54 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  29.93 
 
 
636 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  27.3 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  37.41 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  25 
 
 
585 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  34.51 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.78 
 
 
631 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  32.6 
 
 
615 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  29.52 
 
 
592 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  26.57 
 
 
597 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.83 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  36.5 
 
 
246 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  34.09 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  31.75 
 
 
618 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  37.82 
 
 
638 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  28.57 
 
 
614 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  38.18 
 
 
638 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  30.69 
 
 
618 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 
1103 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  36.3 
 
 
462 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  30.23 
 
 
592 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  36.3 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  36.3 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  36.3 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  36.3 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  36.3 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  36.3 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  28.93 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  34.71 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  39.39 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  26.67 
 
 
473 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  30.47 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  29.66 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  23.92 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 
1103 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  24.66 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  24.25 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  28.4 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  39.33 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  35.56 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  36.36 
 
 
474 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  29.37 
 
 
442 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  27.95 
 
 
261 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  31.25 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  33.06 
 
 
402 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  45.61 
 
 
315 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  23.99 
 
 
341 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  41.86 
 
 
307 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  23.99 
 
 
342 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  33.33 
 
 
223 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  29.52 
 
 
339 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  24.48 
 
 
320 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  32.99 
 
 
259 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
273 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
313 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  28.99 
 
 
360 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  28.92 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  33.64 
 
 
1533 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  28.32 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  49.15 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  27.42 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  49.15 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  33.64 
 
 
658 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  33.64 
 
 
636 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  33.64 
 
 
658 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  49.15 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  33.64 
 
 
658 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  33.72 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  35.14 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  29.63 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  31.21 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  29.53 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  27.7 
 
 
342 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  34.65 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  29.1 
 
 
360 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40.7 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  35.56 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  31.88 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  24.44 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>