More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2214 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  641    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  40.71 
 
 		 309 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  35.24 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  39.13 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  36.36 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.91 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  32.56 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.11 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  30.86 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  27.4 
 
 		 290 aa  119  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  33.88 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  28.34 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  27.44 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  32.02 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.37 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  29.92 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  29.83 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  28.87 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  29.67 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  29.8 
 
 		 295 aa  99.4  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  29.71 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  31.67 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 		 319 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  30.23 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.05 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  30.42 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  29.08 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  31.17 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  31.71 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.1 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.46 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.46 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.63 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  29.03 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  27.09 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  24.78 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.05 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  26.25 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  26.83 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  26.09 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  30 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2712  hypothetical protein  28.47 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00940058  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl606  putative hydrolase  25.11 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  27.07 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  24.24 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0659  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.75 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  23.28 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  25.31 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  28.93 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0385  hypothetical protein  27.61 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740137  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0126  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.46 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  28.87 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0588  putative alpha/beta superfamily hydrolase  25.7 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.13 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  27.53 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3566  hypothetical protein  28.78 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1656  secreted protein  24.71 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000081401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  25.12 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  25.1 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  25.1 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  25.2 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  25.11 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  25.54 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  25.1 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2435  putative hydrolase  28.26 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0653999  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  25.1 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  28.87 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  25.47 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13780  alpha/beta hydrolase family protein  25.53 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  26.36 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  27.75 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  25.2 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  24.35 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  26.72 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  26.72 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  23.45 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  26.72 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  25.25 
 
 		 648 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  25.17 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>