85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2435 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2435  putative hydrolase  100 
 
 		 265 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0653999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0292  putative hydrolase  61.75 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  52.92 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  51.05 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7972  hypothetical protein  49.6 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  47.01 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6824  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  41.11 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6175  hypothetical protein  43.78 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4984  peptidase S15  40.65 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  34.27 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0444  hypothetical protein  32.66 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  25.3 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  32.38 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  30.2 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  24.79 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  27.13 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  28.26 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  27.75 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.16 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  23.6 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.16 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.91 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  24.8 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  26.2 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  24.8 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  21.55 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.85 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  20.86 
 
 		 314 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  27.64 
 
 		 319 aa  52.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  26.87 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  29.49 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.28 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  25.29 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  31.58 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  23.83 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  28.16 
 
 		 467 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  27.87 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  26.11 
 
 		 319 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  26.11 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.63 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  30.4 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  27.12 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  24.51 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  27.62 
 
 		 319 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.63 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  28.4 
 
 		 409 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  29.33 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  26.57 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  35.71 
 
 		 314 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  29.78 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  24.51 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  25.76 
 
 		 405 aa  46.6  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  24.51 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  24.51 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  24.51 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  24.51 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  24.51 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  22.79 
 
 		 308 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  24.51 
 
 		 307 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.57 
 
 		 750 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  24.02 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  29.29 
 
 		 408 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  23.65 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  25.64 
 
 		 691 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  30.14 
 
 		 412 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.77 
 
 		 760 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.38 
 
 		 689 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.99 
 
 		 767 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  22.83 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1592  secreted protein  30.92 
 
 		 392 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  27.52 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  23.05 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  39.29 
 
 		 325 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  27.33 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  26.09 
 
 		 775 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  26.46 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.23 
 
 		 765 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  26 
 
 		 392 aa  42  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>