110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8252 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  55.47 
 
 
255 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  50.2 
 
 
254 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7972  hypothetical protein  50.98 
 
 
263 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2435  putative hydrolase  47.01 
 
 
265 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0653999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0292  putative hydrolase  45.56 
 
 
263 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6824  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  44.94 
 
 
283 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6175  hypothetical protein  52.2 
 
 
279 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4984  peptidase S15  43.41 
 
 
266 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0444  hypothetical protein  38.74 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  32.92 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  28.44 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  34.62 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.6 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.95 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  29.06 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  30.73 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.09 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  29.62 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  30.26 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  29.18 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  26.21 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.4 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  28.27 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  25.19 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  27.54 
 
 
319 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 
300 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.34 
 
 
296 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  29.6 
 
 
467 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  27.85 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  27.69 
 
 
283 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  27.52 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.26 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  25.12 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  26.09 
 
 
308 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  25.12 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  25.12 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  25.12 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  25.12 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  26.55 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  25.12 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  26.12 
 
 
319 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  24.64 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  25.41 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  25.12 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0126  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.33 
 
 
280 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  24.15 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  23.39 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  24.42 
 
 
277 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  28.77 
 
 
313 aa  53.1  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  26.85 
 
 
266 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  28.51 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  26.25 
 
 
292 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0215  hydrolase of the alpha/beta superfamily  24.22 
 
 
316 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000127658  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  28.97 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  25.32 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1295  hypothetical protein  30.83 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00733606 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  23.32 
 
 
311 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  26.06 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.78 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  39.62 
 
 
293 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  39.62 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  29.88 
 
 
277 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  39.62 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  39.62 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  39.62 
 
 
284 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  39.62 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  39.62 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  39.62 
 
 
293 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  26.07 
 
 
314 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.22 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  25.79 
 
 
292 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  25.79 
 
 
292 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  25.79 
 
 
292 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  22.12 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0385  hypothetical protein  29.82 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  25.93 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  26.1 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  28.35 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  23.77 
 
 
282 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0822  hypothetical protein  23.22 
 
 
376 aa  47.4  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  37.74 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
330 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  25.22 
 
 
310 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  29.46 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  22.1 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  27.2 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  27.31 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  29.07 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  24.51 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  26.19 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  25.44 
 
 
296 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  30.71 
 
 
227 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  40.68 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  40.68 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  40.68 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1592  secreted protein  28.48 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>