51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_13780  alpha/beta hydrolase family protein  100 
 
 
451 aa  879    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1592  secreted protein  42.43 
 
 
392 aa  242  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121607  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1663  secreted protein  41.08 
 
 
443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1656  secreted protein  37.25 
 
 
425 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000081401 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12930  hypothetical protein  37.47 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15580  alpha/beta hydrolase family protein  34.18 
 
 
405 aa  193  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0659  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  39.39 
 
 
388 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6355  hypothetical protein  37.57 
 
 
337 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  26.37 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  25.53 
 
 
313 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  27.99 
 
 
305 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  25.2 
 
 
306 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  26.83 
 
 
312 aa  56.6  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.56 
 
 
259 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.13 
 
 
314 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  22.22 
 
 
309 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  22.34 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.5 
 
 
314 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  25.37 
 
 
292 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.13 
 
 
315 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  25.21 
 
 
295 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.79 
 
 
248 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
324 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.52 
 
 
280 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  26.77 
 
 
325 aa  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1390  hypothetical protein  21.18 
 
 
310 aa  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.55 
 
 
283 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  20.97 
 
 
265 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  25.65 
 
 
278 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.07 
 
 
295 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  27.55 
 
 
282 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  26.84 
 
 
271 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.73 
 
 
302 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  23.75 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  29.38 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  24.68 
 
 
320 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0732  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.39 
 
 
626 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.517111 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  29.03 
 
 
236 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
330 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  30.11 
 
 
294 aa  44.3  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 
278 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  19.28 
 
 
265 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
267 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
273 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  26.61 
 
 
283 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  48.15 
 
 
294 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.32 
 
 
682 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.32 
 
 
682 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.32 
 
 
682 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 
275 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>