52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6355 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6355  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  676    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0659  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  31.91 
 
 
388 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1592  secreted protein  38.62 
 
 
392 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121607  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13780  alpha/beta hydrolase family protein  37.57 
 
 
451 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1663  secreted protein  34.38 
 
 
443 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15580  alpha/beta hydrolase family protein  27.49 
 
 
405 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1656  secreted protein  27.18 
 
 
425 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000081401 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12930  hypothetical protein  37.7 
 
 
466 aa  104  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  28.25 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  21.36 
 
 
309 aa  56.6  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  27.84 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  23.67 
 
 
308 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  23.67 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  24.26 
 
 
307 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.3 
 
 
750 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  23.67 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  23.67 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  23.67 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  23.67 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  23.67 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  23.67 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  23.67 
 
 
307 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2712  hypothetical protein  24.36 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00940058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  31.67 
 
 
312 aa  49.3  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  23.08 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  27.12 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  27.81 
 
 
295 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  27.46 
 
 
337 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  25.98 
 
 
763 aa  46.2  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  23.46 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  25.98 
 
 
763 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  49.02 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  33.73 
 
 
760 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  25.34 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  49.02 
 
 
289 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  47.06 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  33.73 
 
 
768 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  25.98 
 
 
763 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  25.98 
 
 
763 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  33.73 
 
 
765 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.53 
 
 
771 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  29.09 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  27.62 
 
 
311 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  26.67 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.62 
 
 
767 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.53 
 
 
766 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.53 
 
 
771 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.53 
 
 
767 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  28.78 
 
 
732 aa  43.5  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.32 
 
 
283 aa  43.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  26.9 
 
 
337 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 
317 aa  42.7  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>