168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1306 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  633  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  38.03 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  36.97 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  36.97 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  36.97 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  36.97 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  36.97 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  36.97 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  36.97 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  37.32 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  36.97 
 
 
307 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  37.32 
 
 
307 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  33.82 
 
 
313 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  32.73 
 
 
313 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  35.68 
 
 
313 aa  155  9e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  34.25 
 
 
320 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  33.89 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  34.36 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  32.77 
 
 
337 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  35.14 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  34.08 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  33.63 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  32.44 
 
 
319 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  30.91 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  34.22 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  32.74 
 
 
319 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.63 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  32.3 
 
 
308 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  30.32 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  29.39 
 
 
311 aa  116  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  31.98 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0588  putative alpha/beta superfamily hydrolase  27.87 
 
 
345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  29.55 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  24.6 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  25.97 
 
 
312 aa  95.5  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.95 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  25.69 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  27.68 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  30 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0215  hydrolase of the alpha/beta superfamily  29.41 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000127658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  27.85 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  28.07 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.31 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.46 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  23.87 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  22.18 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  22.43 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  22.78 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl390  hydrolase  27.39 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0649986  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14054  predicted protein  23.93 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl315  lysophospholipase  24.82 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.71518e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl606  putative hydrolase  25.65 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  24.03 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  29.86 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  24.37 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  24.89 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0822  hypothetical protein  27.72 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  26.27 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  26.56 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  21.88 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  23.59 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  22.7 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  26.13 
 
 
314 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  26.69 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  26.13 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  23.7 
 
 
532 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2435  putative hydrolase  27.75 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0653999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  21.37 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  27.49 
 
 
254 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  21.32 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  24.6 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  21.09 
 
 
292 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  24.28 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  26.91 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1592  secreted protein  26.84 
 
 
392 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121607  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  26.73 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  25.4 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  24.31 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  22.1 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  22.97 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  22.81 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  21.05 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  23.53 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  24.06 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  21.26 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  24.71 
 
 
255 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  24.17 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  20.15 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  25.26 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  25.77 
 
 
265 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1663  secreted protein  23.25 
 
 
443 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0659  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.55 
 
 
388 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.65 
 
 
316 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl482  putative lipase  26.9 
 
 
381 aa  55.5  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.41792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  22.92 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  22.55 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  23.83 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  21.24 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>