More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1409 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
278 aa  547  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  69.09 
 
 
278 aa  381  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  58.43 
 
 
265 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  55.12 
 
 
274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  51.37 
 
 
268 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0547  alpha/beta hydrolase fold protein  52.29 
 
 
263 aa  205  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  37.22 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  37.45 
 
 
279 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  39.06 
 
 
279 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  39.06 
 
 
279 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  39.37 
 
 
279 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
279 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  35.8 
 
 
270 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  35.96 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
303 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
303 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
303 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
303 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  37.36 
 
 
318 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
302 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
280 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
280 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
302 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  37.22 
 
 
320 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  35.98 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  35 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  37.36 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  31.2 
 
 
279 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 
320 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  31.17 
 
 
277 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  31.05 
 
 
277 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  34.7 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 
302 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  35.45 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  36.99 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
306 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  30.77 
 
 
277 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  26.78 
 
 
304 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
289 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  27.97 
 
 
280 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  34.2 
 
 
301 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 
257 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
257 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 
291 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 
315 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
559 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 
291 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
314 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  33.46 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 
324 aa  98.2  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  35.98 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
245 aa  95.9  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  31.2 
 
 
272 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 
303 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  30.71 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  32.32 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  31.18 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  31.18 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
254 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  27 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  31.18 
 
 
267 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  31.18 
 
 
267 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  30.8 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  29.92 
 
 
267 aa  92.4  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  30.8 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  25.81 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.88 
 
 
291 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  30.61 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  30.8 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
267 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  31.07 
 
 
314 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  31.92 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  30.42 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  28.12 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  28.12 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>