139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0072 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  716    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3247  hypothetical protein  48.25 
 
 		 143 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  29.03 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  29.17 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.64 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  31.88 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  33 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  26.19 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  25.7 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  30.16 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  25.77 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.38 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.65 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  25.81 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.83 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  37.69 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  23.4 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  26.73 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.15 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.96 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  27.62 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.5 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  26.61 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  26.43 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  24.16 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  23.93 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  23.93 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  23.93 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  23.93 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  23.93 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.8 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  23.93 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  24.29 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  26.67 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  24.29 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.85 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  28.04 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  24.46 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  26.2 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  23.53 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  27.53 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  25.85 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1399  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.49 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0801845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  28.19 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  25.46 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  23.53 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  24.6 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  22.94 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  24.02 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  24.65 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  22.73 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  27.5 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  24.46 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  24 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0126  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.65 
 
 		 280 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  23.42 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  22.28 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  26.07 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  26.54 
 
 		 615 aa  53.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  30.84 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.84 
 
 		 257 aa  53.1  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 334 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  23.67 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  25 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  27.07 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  37.97 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  26.46 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  35.42 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  23.81 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  24.58 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  22.09 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  25.96 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  26.79 
 
 		 286 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  23.76 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  26.79 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  28.57 
 
 		 278 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  25 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  32.56 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl390  hydrolase  28.32 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0649986  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  27.38 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.48 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  26.36 
 
 		 670 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  23.64 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.83 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  25.56 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  26.37 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  24.52 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  22.4 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl315  lysophospholipase  23.3 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.71518e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1592  secreted protein  26.58 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  24.19 
 
 		 524 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>